Doxygen parece ser o que funcionaria para você.

• Ele pode gerar um navegador de documentação on-line (em HTML) e / ou um off manual de referência de linha (em $ \ mbox {\ LaTeX} $) de um conjunto de arquivos de origem documentados.
• Também há suporte para geração de saída em RTF (MS-Word), PostScript, PDF com hiperlink, HTML compactado e páginas de manual do Unix.
• A documentação é extraída diretamente dos fontes, o que torna muito mais fácil manter a documentação consistente com o código fonte.

Pode ser usado para gerar documentação de C #, junto com outras linguagens como C, Objective-C, PHP, Java, Python.

Você pode fazer isso com o compilador Microsoft C # normal. Embora não seja de código aberto. Sem dúvida, é gratuito, pois usa ferramentas que você já possui.

Para o arquivo C # chamado XMLsample.cs

  csc XMLsample.cs / doc : XMLsample.xml  

produzirá o arquivo xml XMLsample.xml . Ao aplicar uma folha de estilo a isso, você terá um ótimo site. CSS deve servir, embora para uma reforma mais significativa você precise usar XSLT.

veja MSDN

Também está disponível no Mono C # compilador. Mono C # é gratuito e de código aberto.

  mcs XMLsample.cs /doc:XMLsample.xml  

Consulte Página de manual mono

Colocando meu 2c porque estava seguindo a resposta aceita, mas descobri,

O compilador Microsoft C # está fazendo um trabalho incompleto. Ou seja, ele fornece apenas um arquivo xml. Mas para ter um bom site, você ainda terá que aplicar alguma folha de estilo a ele, e é aí que a ponte é quebrada - o compilador C # da Microsoft não faz isso, e as ferramentas de suporte da Microsoft que fazem isso, o Sandcastle Projeto CodePlex, não está mais em desenvolvimento ativo pela Microsoft.

Resumindo, a resposta aceita pode ser boa para o ano de 2014, mas não é mais boa para 2017.

A nova resposta é Construtor de arquivos de ajuda do Sandcastle strong de Eric Woodruff > site em https://GitHub.com/EWSoftware/SHFB, que é bifurcado e baseado no código-fonte existente do Sandcastle.

Usamos Documento! X e funciona muito bem para nós. Você obtém os documentos completos da API a partir dos comentários e as folhas de estilo tornam a aparência muito bonita. Eles também respondem muito bem ao suporte.

Dito isso, não é gratuito. Mas pelo que oferece, acho que vale a pena. (Antes usávamos um programa gratuito, não o doxygen, e isso acabou sendo muito caro em termos de tempo que levava.)